西昌学院拥有多个特色专业，以下是一些被广泛认可的专业：
国家级特色专业
中国少数民族语言文学（彝语言文学）
省级特色专业
农学
少数民族语言文学
水利水电工程
动物医学
园艺
食品科学与工程
省级卓越工程师教育培养计划项目所属专业
水利水电工程
食品科学与工程
材料科学与工程
其他特色专业
动物科学
土木工程
小学教育
王牌专业（根据不同的评价标准可能有所不同）：
电子商务
计算机科学与技术
无机非金属材料工程
汉语言文学
英语
生物科学
体育教育
学前教育
旅游管理
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